業績

2023年


<論文>

J. Nakamura, Y. Maruyama, G. Tajima,  S. Hayakawa,  M. Suwa,  C. Sato:

“Ca2+ Dependent Formation/Collapse of Cylindrical Ca2+-ATPase Crystals in Scallop Sarcoplasmic Reticulum (SR) Vesicles: A Possible Dynamic Role of SR in Regulation of Muscle Contraction”

Int. J. Mol. Sci. 202324(8), 7080; https://doi.org/10.3390/ijms24087080

 

 <学会発表>

○溝江竜実、諏訪牧子:

「深層学習を用いた、電子顕微鏡からの肺がん組織判別」

Meetup-in AGU2023@AOYAMA、2023年12月16日(青山学院大学 17号館)

 

○Kento Fujishima, Kenji Etchuya, Hiroshi Arai, Ikuo Masuho, Makiko Suwa:

"Development of Program for Predicting GPCR-G protein Coupling Selectivity, Using Deep Learning and SVM"

The 61st Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2023.11.16 (Nagoya, Japan)

 

諏訪牧子(オーガナイザー、司会):

「理事会シンポジウム『次の時代の生物学と、サステナブルなデータベース維持に向けて』」

第61回 日本生物物理学会年会、2023年11月15日(名古屋国際会議場)

 

○Tatsumi Mizoe, Kenji Etchuya, Makiko Suwa, Chikara Sato:

"Various Data Volume Augmentation and YOLO Versions Evaluation for Deep Learning to Detect Lung Cancers Using Electron Microscopy"

The 61st Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2023.11.14 (Nagoya, Japan)

 

○Kuria Takahashi, Kenji Etchuya, Makiko Suwa:

"Construction of odor map simulator and its application to odor classification"

The 61st Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2023.11.14 (Nagoya, Japan)

 

○諏訪牧子:

「青山学院大学ヘルスイノベーションセンターの取り組み」(生命情報科学研究室の研究紹介の部分を講演)

BioJapan2023、2023年10月12日(パシフィコ横浜)

 

2022年


 <論文>

J. Nakamura, Y. Maruyama, G. Tajima, M. Suwa, C. Sato: 

"Elongation and Contraction of Scallop Sarcoplasmic Reticulum (SR): ATP Stabilizes Ca2+-ATPase Crystalline Array Elongation of SR Vesicles"

Int. J. Mol. Sci. 2022, 23(6), 3311; https://doi.org/10.3390/ijms23063311

  

 <学会発表>

Natsumi Kezuka, Shiho Kasaya, Kenji Etcyuya, Jun Nakamura, Chikara Sato, ○Makiko Suwa:

“Skeletal muscle vesicle morphology discrimination from electron microscope images using deep learning method”

The 60st Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2022.9.30 (Hakodate, Japan)

 

○塚原 百合、越中⾕ 賢治、諏訪 牧⼦:

「膜タンパク質の膜貫通領域と膜外領域におけるコドン使⽤頻度の⽐較」

第45回 日本分子生物学会年会、2022年11月30日〜12月2日(幕張メッセ)

 

2021年


 <論文>

J. Nakamura, Y. Maruyama, G. Tajima,  Y. Komeiji,  M. Suwa,  C. Sato:

"Ca2+-ATPase Molecules as a Calcium-Sensitive Membrane-Endoskeleton of Sarcoplasmic Reticulum"

Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(5), 2624; https://doi.org/10.3390/ijms22052624

 

 <学会発表>

○Hiroshi Arai, Kenji Etchuya, Chikara Sato, Makiko Suwa:

“Improving Accuracy and Real-Time Prediction of Cancer Tissue Detection from Electron Microscope Images Using Deep Learning“

第10回 生命医薬情報学連合大会、2021年9月27日〜29日(オンライン開催)

 

○菅野七香、伊藤真優、間中智実、越中谷賢治、諏訪牧子:

「MDシミュレーションによる、アドレナリン受容体―Gタンパク質結合選択性解析」

第44回 日本分子生物学会年会、2021年12月1日~3日(パシフィコ横浜 現地参加型、オンライン型併用開催)

 

○蝦名 里月、越中谷 賢治、諏訪 牧子:

「二項関係データベースを基にしたGPCR下流シグナル伝達経路の探索および推定」

第44回 日本分子生物学会年会、2021年12月1日~3日(パシフィコ横浜 現地参加型、オンライン型併用開催)

 

2018年


 <論文>

M.Ikeda, M. Sugihara, M. Suwa:

“SEVENS: a database for comprehensive GPCR genes obtained from genomes: -Update to 68 eukaryotes“

Biophys Physicobiol. 2018 Volume 15, Pages 104-110; https://doi.org/10.2142/biophysico.15.0_104 

 

2016年


 <学会発表>

○Tsukasa Ueno, Masato Sakai, Masami Ikeda, Makiko Suwa:

“We found at least 93 membrane protein folds in structure classification”

The 54th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2016.11.25-27 (Tukuba, Japan)

 

○Mika Miyagaki, Ei Itou, Murasaki Kasuga, Minori Kominato, Masami Ikeda and Makiko Suwa:

“Ligand prediction of orphan GPCRs based on physicochemical characters of ligand binding pocket"

第5回 生命医薬情報学連合大会、2016年9月29日〜10月1日(東京国際交流館プラザ平成)

 

2015年


 <論文>

Suresh MX,  Gromiha MM,  Suwa M:

“Development of a machine learning method to predict membrane protein-ligand binding residues using basic sequence information.”  Adv. Bioinformatics, 2015(843030); https://doi.org/10.1155/2015/843030

 

 <書籍>

諏訪牧子

「日本バイオインフォマティクス学会編 バイオインフォマティクス入門」第4章 構造解析 分担執筆、慶応大学義塾出版会 (2015)

特許


タンパク質情報処理装置および方法、諏訪牧子 他5名、特許第3793814号

 

ドメインの判別手法と判別装置、諏訪牧子 他2名、特許第3920207号